QT MPEG4 Exporterがサポートするファイル形式には様々なパラメータが存在しますが、QT MPEG4 Exporter はいくつかのパラメータの組み合わせをはじめから内蔵しています。
おすすめの設定はライブラリ保存用にはMPEG4 (Best Quality)、配布用にはMPEG4 (ISMA profile 1)、携帯電話用には3GPP (QCIF)です。

iPod

QuickTimeが持つiPod用の動画変換機能を使ってH.264の動画を出力します。QuickTimeのバージョンによって出力される動画の規格が異なります。これを書いている時点のQuickTime 7.2においてはVGAサイズ（640x480）のH.264を出力します。QuickTime 7.0.2以上が必要です。

iPhone

QuickTimeが持つiPhone用の動画変換機能を使ってH.264の動画を出力します。iPod用の設定に比べるとやや解像度が小さく、iPhoneとiPod touchに最適化されます。QuickTime 7.2以上が必要です。

Apple TV

QuickTimeが持つApple TV用の動画変換機能を使ってH.264の動画を出力します。HDクラスの動画が変換できますが、iPodでは再生できません。iTunesやFront RowでHD品質の動画を鑑賞するのに向いています。QuickTime 7.1.2以上が必要です。

MPEG-4 (H.264/AVC)

QuickTime 7がインストールされた環境のみで利用できる、最新の映像CODECです。標準のMPEG-4 CODECよりも低いビットレートでより高画質を実現します。可変ビットレートにより、QCIFからHDまでの大きさに対応し、高速エンコードが行えます。音声は可変ビットレートのAAC方式によりCD品質で効率よくエンコードされます。QuickTime 7がインストールされた環境で利用できるモードです。

MPEG-4 (MPEG-4 SP)

MPEG4を使ってQuickTime 6の上限である 2Mbpsの高画質エンコーディングを行います。ビデオの大きさは表示中のものがそのまま反映されます。音声は128kbpsのAAC方式によりCD品質に近いものとなります。MPEG4形式でライブラリを保存するのに最適ですが、場合によっては元データよりもムービーが大きくなってしまうかも知れません。DV形式やMPEG2よりは圧縮率が高いので、それらの形式が大きすぎて嫌いな人向けです。

MPEG4 (last setting)

MPEG4の出力で最後に使用した設定に従います。MPEG4による出力を使用したことがない場合、ISMA profile 1での出力となるようです。QuickTime Proユーザーの場合、カスタム設定を使用することができます。

3GPP (DoCoMo & Vodafon / W-CDMA)

DoCoMoやVodafoneを含むW-CDMAの第3世代携帯電話の端末で再生できる形式です。実際のサポート状況は個々の端末によって違い、第2世代の端末であっても、サポートしている端末もありますし、第3世代の端末であってもサポートしていないプロファイルがあります。画質優先のQCIFサイズの設定、互換性重視のSub-QCIFサイズの設定、メールにも添付しやすいLightサイズの高圧縮の設定が選択できます。Vodafone V601SHなどの機種でのみ再生できる、規格外の高ビットレートの最高画質のQVGAサイズや、SH900i専用のHalfQVGAサイズの動画像にも対応しています。au端末でもW21CAの場合にはWQVGAサイズの3GPP形式を利用することができます。QuickTime 6.3以上が必要です。

3GPP2 (au / CDMA2000)

3GPP2対応のau端末に対応しています。画質優先のQCIFサイズ、互換性重視のSub-QCIFサイズ、メールにも添付しやすい高圧縮のEzムービーLightの設定が選択できます。一部の機種でのみ再生できる規格外の最高画質のQVGAサイズにも対応しています。QuickTime 6.5以上が必要です。

AMC (au)

au端末向けのメールに添付可能な形式です。画質優先のQCIFサイズ（Lサイズ）、互換性重視のSub-QCIFサイズ（Mサイズ）、メールにも添付しやすい高圧縮のEzムービーLight（Sサイズ）の設定が選択できます。QuickTime 6.5以上が必要です。

3G (last setting)

QuickTime Proで3G（3GPP、3GPP2、AMC）のカスタム設定を使用したい人向けです。最後に使用した設定で出力します。QuickTime 6.3以上が必要です。

QuickTime (Sorenson)

QuickTime 6が動作しないような古いMacintoshにデータを移動するための設定です。漢字Talk7.5とQuickTime 3くらいの環境でも再生できるはずです。圧縮方式はSorenson Videoを使用します。

QuickTime (Lossless)

QuickTimeで再生できるデータを可逆圧縮で出力し直す設定です。QuickTimeでしか再生できない形式の動画をMPEG Exporter TNGなどに渡すために使用できます。可逆圧縮なので、しばしば用いられる無圧縮AVIよりもファイルサイズが小さくてすみます。

QuickTime Movie (last setting)

QuickTime Movieの書き出しに最後に使用した設定で書き出します。QuickTime Proユーザーは最後に使用したカスタム設定を利用できます。

AVI

標準的なWindows環境でも再生できる形式のムービーです。互換性の高い古典的なCinepak、画質の劣化がない無圧縮、QuickTime Proのlast settingの3種類が使用できます。

DV stream

デジタルビデオカメラ用の形式に出力できます。ムービーをデジタルカメラに書き戻すのに使えます。

MPEG2

Final Cut ProやiDVDなどのApple純正のDVD作成ソフトが必要です(?)。

AIFF

音声のみをMacintoshで標準的な形式で出力します。

WAVE

音声のみをWindowsで標準的な形式で出力します。

QuickTimeが対応する3GPP3、GPP2、AMCなどの出力も可能なので、FOMA、VGS、auなどの3G端末に対応したムービーを作成することができます。メール添付用やメモリーカード用などの設定をあらかじめ備えています。
設定を記述したプロファイルデータはネットワークインストーラにより更新されます。アップデータを適用した後の携帯電話向けの主なモードとパラメータの一覧は以下とおりです。

モード	ビットレート	フレームレート	音声	備考
MPEG-4 ISMA profile 1	600kbps	制限なし	AAC 128kbps	P900iVシーク対応
QVGA HQ	384kbps	24fps	AMR 12.2kbps AAC 128kbps	P900iVシーク対応
QVGA SP	384kbps	15fps	AMR 12.2kbps AAC 64kbps	P900iVシーク対応
QVGA LP	128kbps	12fps	AMR 12.2kbps AAC 48kbps	P900iVシーク対応
Half QVGA	192kbps	15fps	AAC 80kbps	FOMA 900iシリーズ用
QCIF HQ	128kbps	15fps	AMR 10.2kbps AAC 80kbps AAC 64kbps	3GPP/3GPP2 3GPP 3GPP2
QCIF (L size)	64kbps	12fps	AMR 10.2kbps AMR 10.2kbps QCELP 14kbps	3GPP 3GPP2 AMC
SubQCIF (M size)	32kbps	8fps 7.5fps 7.5fps	AMR 7.4kbps AMR 7.4kbps QCELP 6.8kbps	3GPP 3GPP2 AMC
Light (S size)	16kbps	7.5fps	QCELP 6.8kbps	au端末専用

フレームレート制限なしの場合、元の動画データと同じフレームレートになります。
QCIFまでの大きさはメール添付時の互換性を重視しています。QCIF HQ以上の大きさは現行機種を対象にして、ローカルでの画質と音質を優先しています。

機種別おすすめモード

主な機種と対応モードを紹介します。

DoCoMo FOMA P900iV

MPEG-4 ISMA profile 1、高画質用、シーク動作対応。
3GPP QVGA LP AAC、長時間録画用、シーク動作対応。

DoCoMo FOMA SH900i

3GPP HalfQVGA AAC、専用モード。
3GPP QVGA LP AAC、長時間録画用。

Vodafone V601/602SH

3GPP QVGA HQ AMR、高画質用。
3GPP QVGA LP AMR、長時間録画用。

au W21SA

3GPP2 QVGA SP AAC、高画質用。
3GPP2 QVGA LP AAC、長時間録画用。

その他のDoCoMo 900iシリーズ

3GPP QCIF HQ AAC。

その他のDoCoMo端末

3GPP QCIF HQ AAC。

その他のVodafone端末（J-SH53含む）

3GPP QCIF HQ。

その他のau端末（2004年以降の主な機種）

3GPP2 QCIF HQ AAC。